Desarrollan GCanner, un software clave para estudiar el genoma del parásito de Chagas

Investigadores del CONICET y de la UNSAM desarrollaron GCanner, una herramienta informática que permite analizar de manera más rápida, precisa y estandarizada el genoma del Trypanosoma cruzi, el parásito que causa la enfermedad de Chagas. Esta enfermedad afecta a 1.300.000 personas en Argentina y a entre 6 y 7 millones en todo el mundo, causando cerca de 10 mil muertes al año. El avance se publicó en la revista científica Methods in Molecular Biology.

El software funciona como un scanner molecular del genoma de Trypanosoma cruzi, revelando una complejidad nunca antes vista en este patógeno. Según Carlos Buscaglia, investigador del CONICET en el Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIBIO) y jefe del laboratorio de Biología molecular de Protozoarios, "estudios como estos nos ayudan a entender las diferencias entre las distintas cepas del parásito y sientan las bases para el desarrollo de estrategias terapéuticas y diagnósticas".

Algunos genes de Trypanosoma cruzi relacionados con la infección y la evasión de las defensas humanas, conocidos como factores de virulencia, se ubican en regiones denominadas "disruptivas", mientras que los genes esenciales para la vida del parásito se encuentran en regiones llamadas "core".

Según Virginia Balouz, también investigadora del CONICET, el desafío más grande de la secuenciación del genoma radicó en comprender la organización de estas regiones disruptivas. Hasta el momento, no existía una herramienta que estandarizara su identificación, lo que provocaba que cada laboratorio utilizara su propio protocolo y generara sesgos en los resultados.

Con GCanner, la identificación de las regiones core y disruptivas se realiza sin necesidad de anotar o interpretar el genoma. Esto mejora la comparación de resultados entre diferentes grupos de investigación y facilita el estudio de la organización genética del parásito.

En 2025, los investigadores publicaron el genoma completo de la cepa autóctona de Trypanosoma cruzi en colaboración con el Instituto Pasteur de Montevideo, Uruguay. Este genoma, detalladamente anotado, ofrece nuevas perspectivas sobre la arquitectura genómica del parásito y es un recurso valioso para la comunidad científica.

El estudio del Trypanosoma cruzi es desafiante debido a su gran diversidad genética. Las diferentes cepas varían en su capacidad de infectar y en la gravedad del daño que causan. Hasta ahora, la comunidad científica contaba con pocos genomas de alta calidad representativos de las cepas en circulación en la región.

Gracias a GCanner, se identificaron cerca de 17 mil genes compartidos con parásitos relacionados y unos 7 mil genes de factores de virulencia exclusivos de Trypanosoma cruzi. Esto permite a los investigadores conocer con exactitud la ubicación de estos genes estratégicos y facilita la integración de resultados entre laboratorios.

En conclusión, GCanner representa un avance significativo en la investigación sobre el parásito de la enfermedad de Chagas, permitiendo desarrollar estrategias diagnósticas y terapéuticas más efectivas.